Όταν ενημερωθεί και ο Οικουμενικός Πατριάρχης τότε θα υπάρξει σχετική τοποθέτηση, αναφέρουν κύκλοι του Πατριαρχείου, σχετικά με τη συμφωνία Τσίπρα – Ιερώνυμου για τον διαχωρισμό Εκκλησιάς-Κράτους.
Το Οικουμενικό Πατριαρχείο δεν έχει ενημερωθεί σχετικά με την συμφωνία και φαίνεται ότι αποτελεί ένα από τα θολά σημεία αυτής της εξέλιξης.
Ειδικότερα, οι κύκλοι του Πατριαρχείου αναφέρουν: «Όταν το Οικουμενικό Πατριαρχείο ενημερωθεί επισήμως για τις προθέσεις της κυβέρνησης, ο Παναγιώτατος θα ενημερώσει την Ιερά και Αγία Σύνοδο, η οποία συνεδριάζει στις 27 Νοεμβρίου και η οποία θα τοποθετηθεί επί αυτού».
Να σημειωθεί πως η Εκκλησία της Κρήτης και η Εκκλησία των Δωδεκαννήσων υπάγονται απευθείας στο Πατριαρχείο.
Συνεπώς τίθενται άμεσα τα ερωτήματα κατά πόσο και πως δεσμεύονται οι δύο αυτές εκκλησίες από τα όσα ανακοίνωσαν από κοινού πρωθυπουργός και αρχιεπίσκοπος.